Provider
Gesellschaft für wissenschaftliche Datenverarbeitung mbH Göttingen (GWDG), Staatliche Naturwissenschaftliche Sammlungen Bayerns/SNSB-IT-Zentrum, Gesellschaft für Biologische Daten e.V.

Voraussetzungen
/

Anwendungsbereich
Planen, Harmonisieren, Verwenden & Archivieren, Entdecken & Erkunden, Verarbeiten & Visualisieren, Support & Training

Link
https://dwb.gfbio.org/

Support
Helpdesk

Die virtuellen Trainingsumgebungen der Diversity Workbench (DWB) an der GWDG bieten kostenlosen Remote-Zugriff auf DWB-Clients und SQL-Datenbank-Software. Der Zugang wird über eine NFDI-Authentifizierung mit DWB-Autorisierung der einzelnen Anwender organisiert. Die Instanzen enthalten Testdaten aus Forschungsprojekten und bieten Zugriff auf Terminologien und Taxonomien. Ein Datenaustausch mit externen Ressourcen ist möglich. Die Parent-Instanz an den SNSB und die Child-Instanzen an der GWDG werden regelmäßig technisch aktualisiert (SaaS).

Provider
Gesellschaft für Biologische Daten e.V.

Voraussetzungen
Keine; für persönlichen Support wird ein Account benötigt

Anwendungsbereich
Planen

Link
https://dmp.gfbio.org

Support
Helpdesk

Der GFBio-Data-Management-Plan-Service besteht aus einer Selbstbedienungsfunktion und optionaler individueller Unterstützung bei der Erstellung von Datenmanagementplänen (DMPs) für biodiversitätsbezogene Projekte. Das Tool ist nach den Kategorien (1) Allgemeine Projektinformationen, (2) Datenerhebung, (3) Dokumentation und Metadaten, (4) Ethik und Rechtskonformität und (5) Bewahrung und Weitergabe strukturiert. Auf der Grundlage der Eingaben wird mit persönlicher Unterstützung unserer DMP-Beauftragten ein Datenmanagementplan entwickelt.

Provider
Gesellschaft für Biologische Daten e.V.

Voraussetzungen
Keine

Anwendungsbereich
Planen, Harmonisieren, Verwenden & Archivieren, Entdecken & Erkunden, Verarbeiten & Visualisieren, Support & Training

Link
www.gfbio.org

Support
Helpdesk

Das GFBio-Portal ist die zentrale Anlaufstelle für Daten und assoziierte Dienste entlang des Datenlebenszyklus, die die Gesellschaft für Biologische Daten in Bremen bereit stellt. Forschende finden dort Zugang zu den Daten von zehn einschlägigen Datenzentren sowie erprobte Dienste und Beratung für Datenmanagementpläne, Datenanalysen, -publikationen und -archivierung. Das GFBio Wiki und verschiedene Selbstlernmaterialien aus den GFBio Roadshows vermitteln Wissen rund um das Thema biologische, ökologische und umweltbezogene Daten.

Provider
Freie Universität Berlin, Botanischer Garten und Botanisches Museum Berlin

Voraussetzungen
Server mit laufender Python- und Webserver-Software, primäre Biodiversitätsdaten (Beobachtungen, Exemplare) in relationaler Datenbank oder Excel/CSV-Dateien

Anwendungsbereich
Harmonisieren, Verwenden & Archivieren

Link
www.biocase.org/provider_software

Support
Helpdesk

Die BioCASe (Biological Collections Access Service) Provider Software ist eine Middleware zur Bereitstellung von Daten aus einer relationalen Datenbank für Informationsnetzwerke nach den FAIR-Prinzipien. Nach der Installation von BioCASe und der Konfiguration für eine bestimmte Datenbank sind die veröffentlichten Informationen als BioCASe-Webservice zugänglich. Obwohl BioCASe für jedes konzeptionelle XML-Datenschema verwendet werden kann, ist der Hauptanwendungsbereich die Veröffentlichung von Vorkommensdaten aus Proben- oder Beobachtungsdatenbanken für primäre Biodiversitätsdatennetzwerke wie das Global Genome Biodiversity Network oder die Global Biodiversity Information Facility unter Verwendung des ABCD-Datenstandards und seiner Erweiterungen.

Provider
Gesellschaft für wissenschaftliche Datenverarbeitung mbH Göttingen (GWDG), Staatliche Naturwissenschaftliche Sammlungen Bayerns/SNSB-IT-Zentrum, Gesellschaft für Biologische Daten e.V.

Voraussetzungen
Keine

Anwendungsbereich
Planen, Harmonisieren, Verwenden & Archivieren, Entdecken & Erkunden, Verarbeiten & Visualisieren, Support & Training

Link
https://dwb.gfbio.org/

Support
Helpdesk

Die virtuellen Trainingsumgebungen der Diversity Workbench (DWB) an der GWDG bieten kostenlosen Remote-Zugriff auf DWB-Clients und SQL-Datenbank-Software. Der Zugang wird über eine NFDI-Authentifizierung mit DWB-Autorisierung der einzelnen Anwender organisiert. Die Instanzen enthalten Testdaten aus Forschungsprojekten und bieten Zugriff auf Terminologien und Taxonomien. Ein Datenaustausch mit externen Ressourcen ist möglich. Die Parent-Instanz an den SNSB und die Child-Instanzen an der GWDG werden regelmäßig technisch aktualisiert (SaaS).

Provider
Gesellschaft für Biologische Daten e.V.

Voraussetzungen
Keine

Anwendungsbereich
Harmonisieren, Verwenden & Archivieren

Link
https://submissions.gfbio.org

Support
Helpdesk

Der GFBio Data Submission Service ermöglicht die Einreichung von (heterogenen) biologischen, ökologischen und umweltbezogenen Datensätzen für die Archivierung in einem föderierten Netzwerk von Datenzentren. Die Datensätze werden von Fachexperten des jeweiligen GFBio-Datenzentrums geprüft und kuratiert. Die kuratierten Datensätze werden dann langfristig archiviert und mit einem persistenten Identifier veröffentlicht (z.B. DOI, Accession numbers). Heterogene Daten können in zwei oder mehr Datenzentren archiviert und veröffentlicht werden und sind dann über ihre persistenten Identifier miteinander verknüpft.

Provider
Gesellschaft für Biologische Daten e.V.

Voraussetzungen
None

Anwendungsbereich
Planen, Harmonisieren, Verwenden & Archivieren, Entdecken & Erkunden, Verarbeiten & Visualisieren, Support & Training

Link
www.gfbio.org

Support
Helpdesk

Das GFBio-Portal ist die zentrale Anlaufstelle für Daten und assoziierte Dienste entlang des Datenlebenszyklus, die die Gesellschaft für Biologische Daten in Bremen bereit stellt. Forschende finden dort Zugang zu den Daten von zehn einschlägigen Datenzentren sowie erprobte Dienste und Beratung für Datenmanagementpläne, Datenanalysen, -publikationen und -archivierung. Das GFBio Wiki und verschiedene Selbstlernmaterialien aus den GFBio Roadshows vermitteln Wissen rund um das Thema biologische, ökologische und umweltbezogene Daten.

Provider
Museum für Naturkunde – Leibniz-Institutfür Evolutions- und Biodiversitätsforschung

Voraussetzungen
Nutzerkonto; laufende BioCASe-Provider-Software-Instanz

Anwendungsbereich
Verwenden & Archivieren, Entdecken & Erkunden, Verarbeiten & Visualisieren

Link
https://bms.gfbio.org/

Support
Helpdesk

Der BioCASe Monitor Service (BMS) ist ein webbasiertes Tool für Koordinatoren verteilter Datennetze, die über die BioCASe Provider Software Informationen an Webportale und Datenaggregatoren liefern. Er hat drei Hauptzwecke: (1) Überwachung des Fortschritts der Datenbereitstellung durch die Anbieter, (2) Erleichterung der Überprüfung von Datenmappings mit Schwerpunkt auf Struktur, Plausibilität und Vollständigkeit und (3) Überprüfung der Konformität der bereitgestellten Daten für die Transformation in andere Zielschemata.

Provider
Freie Universität Berlin, Botanischer Garten und Botanisches Museum Berlin

Voraussetzungen
Server mit laufender Python- und Webserver-Software, primäre Biodiversitätsdaten (Beobachtungen, Exemplare) in relationaler Datenbank oder Excel/CSV-Dateien

Anwendungsbereich
Harmonisieren, Verwenden & Archivieren

Link
www.biocase.org/provider_software

Support
Helpdesk

Die BioCASe (Biological Collections Access Service) Provider Software ist eine Middleware zur Bereitstellung von Daten aus einer relationalen Datenbank für Informationsnetzwerke nach den FAIR-Prinzipien. Nach der Installation von BioCASe und der Konfiguration für eine bestimmte Datenbank sind die veröffentlichten Informationen als BioCASe-Webservice zugänglich. Obwohl BioCASe für jedes konzeptionelle XML-Datenschema verwendet werden kann, ist der Hauptanwendungsbereich die Veröffentlichung von Vorkommensdaten aus Proben- oder Beobachtungsdatenbanken für primäre Biodiversitätsdatennetzwerke wie das Global Genome Biodiversity Network oder die Global Biodiversity Information Facility unter Verwendung des ABCD-Datenstandards und seiner Erweiterungen.

Provider
Gesellschaft für wissenschaftliche Datenverarbeitung mbH Göttingen (GWDG), Staatliche Naturwissenschaftliche Sammlungen Bayerns/SNSB-IT-Zentrum, Gesellschaft für Biologische Daten e.V.

Voraussetzungen
Keine

Anwendungsbereich
Planen, Harmonisieren, Verwenden & Archivieren, Entdecken & Erkunden, Verarbeiten & Visualisieren, Support & Training

Link
https://dwb.gfbio.org/

Support
Helpdesk

Die virtuellen Trainingsumgebungen der Diversity Workbench (DWB) an der GWDG bieten kostenlosen Remote-Zugriff auf DWB-Clients und SQL-Datenbank-Software. Der Zugang wird über eine NFDI-Authentifizierung mit DWB-Autorisierung der einzelnen Anwender organisiert. Die Instanzen enthalten Testdaten aus Forschungsprojekten und bieten Zugriff auf Terminologien und Taxonomien. Ein Datenaustausch mit externen Ressourcen ist möglich. Die Parent-Instanz an den SNSB und die Child-Instanzen an der GWDG werden regelmäßig technisch aktualisiert (SaaS).

Provider
Gesellschaft für Biologische Daten e.V.

Voraussetzungen
Keine

Anwendungsbereich
Harmonisieren, Verwenden & Archivieren

Link
https://submissions.gfbio.org

Support
Helpdesk

Der GFBio Data Submission Service ermöglicht die Einreichung von (heterogenen) biologischen, ökologischen und umweltbezogenen Datensätzen für die Archivierung in einem föderierten Netzwerk von Datenzentren. Die Datensätze werden von Fachexperten des jeweiligen GFBio-Datenzentrums geprüft und kuratiert. Die kuratierten Datensätze werden dann langfristig archiviert und mit einem persistenten Identifier veröffentlicht (z.B. DOI, Accession numbers). Heterogene Daten können in zwei oder mehr Datenzentren archiviert und veröffentlicht werden und sind dann über ihre persistenten Identifier miteinander verknüpft.

Provider
Gesellschaft für Biologische Daten e.V.

Voraussetzungen
Keine

Anwendungsbereich
Planen, Harmonisieren, Verwenden & Archivieren, Entdecken & Erkunden, Verarbeiten & Visualisieren, Support & Training

Link
www.gfbio.org

Support
Helpdesk

Das GFBio-Portal ist die zentrale Anlaufstelle für Daten und assoziierte Dienste entlang des Datenlebenszyklus, die die Gesellschaft für Biologische Daten in Bremen bereit stellt. Forschende finden dort Zugang zu den Daten von zehn einschlägigen Datenzentren sowie erprobte Dienste und Beratung für Datenmanagementpläne, Datenanalysen, -publikationen und -archivierung. Das GFBio Wiki und verschiedene Selbstlernmaterialien aus den GFBio Roadshows vermitteln Wissen rund um das Thema biologische, ökologische und umweltbezogene Daten.

Provider
BIBI/Uni Bielefeld

Requirements
LS Login, BIIGLE Account

Area of Application
Entdecken & Erkunden, Verarbeiten & Visualisieren

Link
www.biigle.de

Support
Helpdesk

BIIGLE ist eine webbasierte Software für die Bild- und Videoannotation, die die kollaborative Forschung an großen Datenbeständen ermöglicht. Sie bietet Werkzeuge für die manuelle und computergestützte Annotation, Qualitätskontrolle und die Zusammenarbeit an benutzerdefinierten Taxonomien zur Beschreibung von Objekten. BIIGLE ist frei verfügbar und kann in Cloud-Umgebungen, einem lokalen Netzwerk oder auf mobilen Plattformen während Forschungsexpeditionen installiert werden. Die öffentliche Instanz auf biigle.de ist für die nicht-kommerzielle Nutzung frei.

Provider
Museum für Naturkunde – Leibniz-Institutfür Evolutions- und Biodiversitätsforschung

Voraussetzungen
Nutzerkonto; laufende BioCASe-Provider-Software-Instanz

Anwendungsbereich
Verwenden & Archivieren, Entdecken & Erkunden, Verarbeiten & Visualisieren

Link
https://bms.gfbio.org/

Support
Helpdesk

Der BioCASe Monitor Service (BMS) ist ein webbasiertes Tool für Koordinatoren verteilter Datennetze, die über die BioCASe Provider Software Informationen an Webportale und Datenaggregatoren liefern. Er hat drei Hauptzwecke: (1) Überwachung des Fortschritts der Datenbereitstellung durch die Anbieter, (2) Erleichterung der Überprüfung von Datenmappings mit Schwerpunkt auf Struktur, Plausibilität und Vollständigkeit und (3) Überprüfung der Konformität der bereitgestellten Daten für die Transformation in andere Zielschemata.

Provider
Gesellschaft für wissenschaftliche Datenverarbeitung mbH Göttingen (GWDG), Staatliche Naturwissenschaftliche Sammlungen Bayerns/SNSB-IT-Zentrum, Gesellschaft für Biologische Daten e.V.

Voraussetzungen
Keine

Anwendungsbereich
Planen, Harmonisieren, Verwenden & Archivieren, Entdecken & Erkunden, Verarbeiten & Visualisieren, Support & Training

Link
https://dwb.gfbio.org/

Support
Helpdesk

Die virtuellen Trainingsumgebungen der Diversity Workbench (DWB) an der GWDG bieten kostenlosen Remote-Zugriff auf DWB-Clients und SQL-Datenbank-Software. Der Zugang wird über eine NFDI-Authentifizierung mit DWB-Autorisierung der einzelnen Anwender organisiert. Die Instanzen enthalten Testdaten aus Forschungsprojekten und bieten Zugriff auf Terminologien und Taxonomien. Ein Datenaustausch mit externen Ressourcen ist möglich. Die Parent-Instanz an den SNSB und die Child-Instanzen an der GWDG werden regelmäßig technisch aktualisiert (SaaS).

Provider
Gesellschaft für Biologische Daten e.V.

Voraussetzungen
Keine

Anwendungsbereich
Planen, Harmonisieren, Verwenden & Archivieren, Entdecken & Erkunden, Verarbeiten & Visualisieren, Support & Training

Link
www.gfbio.org

Support
Helpdesk

Das GFBio-Portal ist die zentrale Anlaufstelle für Daten und assoziierte Dienste entlang des Datenlebenszyklus, die die Gesellschaft für Biologische Daten in Bremen bereit stellt. Forschende finden dort Zugang zu den Daten von zehn einschlägigen Datenzentren sowie erprobte Dienste und Beratung für Datenmanagementpläne, Datenanalysen, -publikationen und -archivierung. Das GFBio Wiki und verschiedene Selbstlernmaterialien aus den GFBio Roadshows vermitteln Wissen rund um das Thema biologische, ökologische und umweltbezogene Daten.

Provider
Gesellschaft für Biologische Daten e.V.

Voraussetzungen
Keine

Anwendungsbereich
Entdecken & Erkunden

Link
https://search.gfbio.org

Support
Helpdesk

GFBio Data Search ermöglicht die Suche nach Datensätzen, die in den GFBio-Datenzentren archiviert und veröffentlicht sind. Daten aus insgesamt sieben Sammlungsdatenzentren und drei domain-spezifischen Repositories können nach biologischen, ökologischen und umweltbezogenen Daten durchsucht werden. Daten, die über den GFBio Data Submission Service eingereicht, archiviert und veröffentlicht wurden, sind ebenfalls über die Data Search auffindbar.

Provider
Museum für Naturkunde – Leibniz-Institutfür Evolutions- und Biodiversitätsforschung

Voraussetzungen
Nutzerkonto; laufende BioCASe-Provider-Software-Instanz

Anwendungsbereich
Verwenden & Archivieren, Entdecken & Erkunden, Verarbeiten & Visualisieren

Link
https://bms.gfbio.org/

Support
Helpdesk

Der BioCASe Monitor Service (BMS) ist ein webbasiertes Tool für Koordinatoren verteilter Datennetze, die über die BioCASe Provider Software Informationen an Webportale und Datenaggregatoren liefern. Er hat drei Hauptzwecke: (1) Überwachung des Fortschritts der Datenbereitstellung durch die Anbieter, (2) Erleichterung der Überprüfung von Datenmappings mit Schwerpunkt auf Struktur, Plausibilität und Vollständigkeit und (3) Überprüfung der Konformität der bereitgestellten Daten für die Transformation in andere Zielschemata.

Provider
Freie Universität Berlin, Botanischer Garten und Botanisches Museum Berlin

Voraussetzungen
Keine

Anwendungsbereich
Verarbeiten & Visualisieren

Link
https://transformation.gfbio.org

Support
Helpdesk

Der Data Transformation Service ist ein webbasierter Dienst zur Umwandlung biodiversitätsbezogener Daten zwischen verschiedenen Community-Formaten wie z.B. ABCD (Access to Biological Collections Data), CDM Light (Common Data Model) und PANGAEA PanSimple. Die derzeit unterstützten Transformationen sind:

• ABCD > PANGAEA PanSimple
• ABCD > HTML Landing Page
• ABCD (Archiv) > DarwinCore Archiv
• CDM Light > PANGAEA PanSimple

Provider
Gesellschaft für wissenschaftliche Datenverarbeitung mbH Göttingen (GWDG), Staatliche Naturwissenschaftliche Sammlungen Bayerns/SNSB-IT-Zentrum, Gesellschaft für Biologische Daten e.V.

Voraussetzungen
Keine

Anwendungsbereich
Planen, Harmonisieren, Verwenden & Archivieren, Entdecken & Erkunden, Verarbeiten & Visualisieren, Support & Training

Link
https://dwb.gfbio.org/

Support
Helpdesk

Die virtuellen Trainingsumgebungen der Diversity Workbench (DWB) an der GWDG bieten kostenlosen Remote-Zugriff auf DWB-Clients und SQL-Datenbank-Software. Der Zugang wird über eine NFDI-Authentifizierung mit DWB-Autorisierung der einzelnen Anwender organisiert. Die Instanzen enthalten Testdaten aus Forschungsprojekten und bieten Zugriff auf Terminologien und Taxonomien. Ein Datenaustausch mit externen Ressourcen ist möglich. Die Parent-Instanz an den SNSB und die Child-Instanzen an der GWDG werden regelmäßig technisch aktualisiert (SaaS).

Provider
Gesellschaft für Biologische Daten e.V.

Voraussetzungen
Keine

Anwendungsbereich
Planen, Harmonisieren, Verwenden & Archivieren, Entdecken & Erkunden, Verarbeiten & Visualisieren, Support & Training

Link
www.gfbio.org

Support
Helpdesk

Das GFBio-Portal ist die zentrale Anlaufstelle für Daten und assoziierte Dienste entlang des Datenlebenszyklus, die die Gesellschaft für Biologische Daten in Bremen bereit stellt. Forschende finden dort Zugang zu den Daten von zehn einschlägigen Datenzentren sowie erprobte Dienste und Beratung für Datenmanagementpläne, Datenanalysen, -publikationen und -archivierung. Das GFBio Wiki und verschiedene Selbstlernmaterialien aus den GFBio Roadshows vermitteln Wissen rund um das Thema biologische, ökologische und umweltbezogene Daten.

Unser Helpdesk ist unsere Anlaufstelle für alle Fragen zum Forschungsdatenmanagement, zur Nutzung von Tools und Diensten sowie für Anfragen zu Schulungen und zur Zusammenarbeit mit NFDI4Biodiversity.

Das Helpdesk-Team leitet Ihre Anfrage an die jeweiligen Expert:innen des NFDI4Biodiversity- und GFBio-e.V.-Netzwerks weiter.

Unsere Partnerinstitutionen bieten (teils regelmäßig, teils auf Anfrage) Trainings zur Nutzung ihrer Tools und Services für die Arbeit mit Biodiversitäts-, Ökologie- und Umweltdaten an.

Nähere Infos finden Sie hier.