BiodiversiTea – die NFDI4Biodiversity Coffee Lecture #6

Austauschen und Tee trinken: Das Onlineformat BiodiversiTea bietet ein Forum zum Vorstellen und Diskutieren von Arbeiten, Projekten, Tools und Themen aus der und um die NFDI4Biodiversity-Community. Einmal im Monat möchten wir uns online für eine Stunde mit euch und Ihnen treffen – für spannende Präsentationen und angeregten Austausch bei einer Tasse Tee (oder Kaffee). Die Runde ist offen für alle, die Lust haben, sich über aktuelle Entwicklungen und Themen rund um Biodiversitätsdaten zu informieren und auszutauschen. Eine Zugehörigkeit zu NFDI4Biodiversity ist nicht notwendig.

Thema im September 2024
Der Digital Diversity Hub: Zentraler Zugang zu vernetzten biowissenschaftlichen Datenbanken

Vortragende
Dr. Julia Koblitz, Head of Team Data Integration, Leibniz-Institut DSMZ – Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH

Darum geht es
In der Mikrobiologie gibt es zahlreiche Datenbanken, die wertvolle Informationen über Mikroorganismen liefern. Diese Ressourcen existieren jedoch oft isoliert voneinander, sodass Forschende von einer Datenbank zur nächsten springen müssen, um umfassende Informationen über einen spezifischen mikrobiellen Stamm zu erhalten. Dieser Prozess führt nicht selten zu Inkonsistenzen und erschwert die Arbeit erheblich.

In ihrem Vortrag stellt Julia Koblitz von der Deutschen Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH (DSMZ) den Digital Diversity Hub vor – eine Plattform, die einen zentralen Zugang zu den integrierten Datenbanken der DSMZ bietet. Durch die Zusammenführung von Ressourcen wie BacDive, BRENDA, StrainInfo, MediaDive, SILVA und weiteren bietet der Hub einen einheitlichen Überblick über physische und digitale Ressourcen. Julia Koblitz wird zeigen, wie diese Plattform Forschende bereits jetzt unterstützt, indem sie Informationen zu Taxonomie, Phänotypen, Genomen, Enzymen, und rRNA-Sequenzen durchsuchbar macht. Anhand eines Beispielstamms demonstriert sie, wie die verschiedenen Ressourcen des Hubs genutzt werden können, um ein vollständiges Bild des Mikroorganismus zu erhalten. Außerdem wird sie einen Ausblick geben, wie der Hub in Zukunft all diese Informationen intelligent verknüpfen und so eine konsistente und umfassende Datenanalyse ermöglichen wird. 

Fragen & Anregungen
Der BiodiversiTea lebt von euren Ideen! Ihr möchtet Feedback einholen, sucht Mitstreiter, möchtet Arbeitsergebnisse vorstellen oder wollt euch zu einem Thema in größerer Runde austauschen? Schreibt uns an helpdesk@nfdi4biodiversity.org oder über unser Helpdesk-Formular und wir gestalten zusammen eine der kommenden Lectures.

Auch bei Fragen freuen wir uns über eine Nachricht an unseren Helpdesk.

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